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13 小时前
机器之心
AlphaFold3不能的,它可以!上交、范德堡团队开发LassoPred:预测套索肽三维结构的工具
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AlphaFold3不能的,它可以!上交、范德堡团队开发LassoPred:预测套索肽三维结构的工具 - 机器之心
编辑 | 萝卜皮 套索肽(LaP)以其缠结状活结结构为特征,是一大类核糖体合成和翻译后修饰的肽(RiPP),例如可用作抗生素、酶抑制剂和分子开关。 虽然生物信息学预测了数千个 LaP 序列,但在过去 30 年中,仅有约 50 个不同的 LaP 被表征为结构特征。 现有的计算工具,例如 AlphaFold2、AlphaFold3 和 ESMfold,由于其不规则的骨架结构(例如套索结状折叠和异肽键的存在),无法准确预测 LaP 的结构。 为了应对这一挑战,上海交通大学、范德堡大学的研究人员开发了 Lass…
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